Em meio a sua jornada além do Mar Podre, a princesa Nausicaä faz novas descobertas sobre aquele mundo moribundo em um estranho mausoléu. O local é habitado por estranhos integrantes de uma seita que são responsáveis pela guarda daquele local. É nele que reside o segredo para salvar e unir a todos. Ao lado de seu “filho”, a heroína parte para uma batalha final desesperadora para impedir que o mundo seja destruído.